Ziraat Türkiye Kupası'nda son 16 Turu eşleşmeleri kura çekiminde belli oldu.
Kura sonunda son 16 turunda eşleşmeler şöyle:
 Medipol Başakşehir - GMG Kırklarelispor
 Çaykur Rizespor - Galatasaray 
Trabzonspor - Yukatel Denizlispor
 Kayserispor - Fenerbahçe
 Antalyaspor - Göztepe
 Demir Grup Sivasspor -  Yeni Malatyaspor 
Aytemiz Alanyaspor - Kasımpaşa
 B.B Erzurumspor - Beşiktaş
 Çift maç eleme usulüne göre oynanacak olan son 16 turunda, 5'inci Eleme Turu müsabakaları sonucu tur atlayan 16 takım mücadele edecek. Ziraat Türkiye Kupası Son 16 Tur ilk maçları 14, 15 ve 16 Ocak 2020, rövanş maçları ise 21, 22 ve 23 Ocak 2020 tarihlerinde oynanacak.